Liquid Biopsy Lab Hirntumore

Diagnostik

Gehört zu

Neurologie und Poliklinik

Kontaktdaten

Leitung

PD Dr. med. Tobias Kessler

Kontakt

E-Mail schreiben 06221 56-35603 06221 56-38265

(Sonstige Telefonnummer)

06221 56-7554

Adresse

Im Neuenheimer Feld 400
69120 Heidelberg
Gebäude 6400

Anfahrt

Öffnungszeiten

Mo – Fr

08:30 – 17:00

Hinweis

*English version below*

Minimalinvasive molekulare Diagnostik von Hirntumoren aus Liquor.

Klinische Szenarien, in denen eine Liquid Biopsy sinnvoll sein kann:

Molekulare Hirntumordiagnostik
Verlaufsmonitoring unter Therapie
Verdacht auf Tumorprogress
Einbindung in klinische Studien

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SCHNELLSTART FÜR IHRE PROBENEINSENDUNG

Für die Probeneinsendung (aus Deutschland) gehen Sie bitte wie folgt vor:

Vor der Probenentnahme:

1. Schritt-für-Schritt-Anleitung lesen

[Download: Einsender-SOP zur Probenentnahme und zum Versand[S1]]

2. Kostenunterlagen vorbereiten

Gesetzlich versichert (Deutschland): Überweisungsschein für in-vitro-diagnostische Auftragsleistungen (Vordruck Nr. 10)
Privat versichert (Deutschland): Kostenübernahmeerklärung ausfüllen und mitsenden

[Download: Kostenübernahmeerklärung (Privatversicherte)][S2])

Während der Probenentnahme:

3. Einsendeformular ausfüllen und mitsenden

[Download: Einsendeformular[S3]]

Nach der Probenentnahme:

4. Proben für Versand vorbereiten (Versandbedingungen beachten)

[Download: SOP zur initialen Probenaufbereitung[S4]]

5. Vor Versand Vollständigkeit prüfen

[Download: Checkliste zur Einsendung[S5]]

Fertig!

Alle Schritte sind in den folgenden Abschnitten zusätzlich ausführlich beschrieben.

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Probenversand bitte an:

Liquid Biopsy Lab Hirntumore
z.H. Andrea Dormann / Sandy Walter
Universitätsklinikum Heidelberg, Kopfklinik
Im Neuenheimer Feld 400
'69120 Heidelberg

Deutschland

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*English*

Minimally invasive molecular diagnostics for brain tumors using cerebrospinal fluid.

Clinical scenarios in which a liquid biopsy may be useful:

Molecular diagnosis of brain tumors
Treatment monitoring
Suspected tumor progression
Integration into clinical trials

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QUICK START FOR SAMPLE SUBMISSION

For sample submission from outside Germany, please proceed as follows:

Before sample collection:

1. Read the step-by-step instructions

[Download: Submitter SOP for sample collection and shipping[S6]]

2. Prepare cost coverage documents

EU countries: Completed S2 form with signature and stamp
Non-EU countries: Please contact the International Office of Heidelberg University Hospital: international.office@med.uni-heidelberg.de

During sample collection:

3. Complete and include the submission form

[Download: Submission form[S7]]

After sample collection:

4. Prepare samples for shipping (follow shipping requirements)

[Download: SOP for initial sample processing[S8]]

5. Check completeness before shipping

[Download: Submission checklist[S9]]

Done!

All steps are described in more detail in the following sections..

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Sample submission (shipping address):

Liquid Biopsy Lab Hirntumore
Attn: Andrea Dormann / Sandy Walter
Universitätsklinikum Heidelberg, Kopfklinik
Im Neuenheimer Feld 400
69120 Heidelberg
Germany

Allgemeine Informationen

*English version below*

ÜBER DAS LIQUID BIOPSY LAB HIRNTUMORE

Liquid Biopsies mit molekularen Analysen aus Liquor und Blut gewinnen zunehmend an Bedeutung für die Diagnostik und Verlaufsbeurteilung von Hirntumoren. Im Gegensatz zur klassischen Gewebebiopsie ist hierfür keine operative Gewebeentnahme erforderlich.

Bei der Liquid Biopsy wird zellfreie DNA (cell-free DNA, cfDNA) aus Körperflüssigkeiten analysiert, die von verschiedenen Körperzellen freigesetzt wird. Ein Teil dieser cfDNA stammt aus Tumorzellen und wird als zirkulierende Tumor-DNA (circulating tumor DNA, ctDNA) bezeichnet. Der Nachweis von ctDNA ermöglicht eine minimalinvasive molekulare Charakterisierung von Hirntumoren.

Im Liquid Biopsy Lab Hirntumore am Universitätsklinikum Heidelberg werden molekulargenetische Analysen sowohl in der klinischen Routine als auch im Rahmen wissenschaftlicher Studien durchgeführt. Dies erfolgt in enger Zusammenarbeit mit der Abteilung für Neuropathologie[S1] .

Durch die Entnahme von Liquor, beispielsweise mittels Lumbalpunktion, können minimalinvasiv wichtige Informationen über die Tumorgenetik gewonnen werden. Hierzu wird zellfreie DNA aus dem Liquor mit einem Next-Generation-Sequencing-(NGS)-Panel von rund 200 hirntumorrelevanten Genen analysiert. Auf diese Weise lassen sich spezifische Mutationen nachweisen, die zur molekularen Diagnose eines Hirntumors beitragen können (Iser et al., 2024).

Darüber hinaus ermöglicht die Methode eine minimalinvasive Verlaufsbeurteilung der Tumoraktivität. Die Ergebnisse der molekulargenetischen Analysen werden interdisziplinär in einem Neuro Liquid Biopsy Board diskutiert und befundet.

Aktuell werden jährlich etwa 150–200 Patientenproben auf diese Weise analysiert. Die Turnaround-Zeit beträgt derzeit in der Regel 10–14 Arbeitstage. Der Befund wird postalisch oder per Fax an das einsendende Zentrum übermittelt.

Im wissenschaftlichen Kontext wird die Methode kontinuierlich weiterentwickelt. Im Rahmen klinischer Studien kommen zusätzlich innovative Technologien wie Nanopore-Sequenzierung und massenspektrometrische Proteomanalysen zum Einsatz.

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*English*

ABOUT THE LIQUID BIOPSY LAB BRAIN TUMORS

Liquid biopsies using molecular analyses of cerebrospinal fluid (CSF) and blood are gaining increasing importance for the diagnosis and monitoring of brain tumors. Unlike conventional tissue biopsies, this approach does not require surgical tissue removal.

In liquid biopsy diagnostics, cell-free DNA (cfDNA) released from various cell types is analyzed from body fluids. A fraction of cfDNA originates from tumor cells and is referred to as circulating tumor DNA (ctDNA). Detecting ctDNA enables minimally invasive molecular characterization of brain tumors.

At the Liquid Biopsy Lab Brain Tumors at Heidelberg University Hospital, molecular genetic analyses are performed both in routine clinical diagnostics and within scientific studies, in close collaboration with the Department of Neuropathology[S2] .

CSF sampling, for example via lumbar puncture, provides a minimally invasive way to obtain important information on tumor genetics. Cell-free DNA from CSF is analyzed using a next-generation sequencing (NGS) panel comprising approximately 200 brain-tumor-relevant genes. This approach enables the detection of specific mutations that can support the molecular diagnosis of brain tumors (Iser et al., 2024).

In addition, the method allows minimally invasive monitoring of tumor activity. Results are discussed in a multidisciplinary Neuro Liquid Biopsy Board.

Currently, approximately 150–200 patient samples per year are analyzed. The current turnaround time is 10–14 working days. The final report is transmitted to the referring center by post or fax.

From a scientific perspective, the method is continuously being refined. Within clinical studies, additional innovative technologies such as nanopore sequencing and mass-spectrometry-based proteomics are applied.

REFERENZ / REFERENCES

Iser F, Hinz F, Hoffmann DC, et al. Cerebrospinal Fluid cfDNA Sequencing for Classification of Central Nervous System Glioma. Clin Cancer Res. 2024;30(14):2974-2985. doi:10.1158/1078-0432.CCR-23-2907

Wichtige Informationen

PROBENEINSENDUNG / SAMPLE SUBMISSION

*English version below*

PROBENENTNAHME

Für eine optimale Probenqualität sollte der Liquor direkt in ein Cell-free DNA-Röhrchen (z. B. Streck Cell-free DNA BCT® CE) abgenommen werden. Diese Röhrchen können auf Anfrage vom Liquid Biopsy Lab Hirntumore zur Verfügung gestellt werden. Ist dies nicht möglich, muss der Liquor unmittelbar nach der Punktion zentrifugiert werden, um den Überstand von den Zellen zu trennen. Zusätzlich wird eine Keimbahnprobe als Referenz benötigt. Hierfür wird EDTA-Blut in einer Standard-EDTA-Monovette eingesendet.

➡️ Praktische Schritt-für-Schritt-Anleitung:

[Download: Einsender-SOP zur Probenentnahme und zum Versand[S1] ]

➡️ Formular zur Einsendung (bitte ausgefüllt mitsenden):

[Download: Einsendeformular[S2] ]

➡️ Zum Abhaken vor Versand:

[Download: Checkliste zur Einsendung[S3] ]

INITIALE PROBENAUFBEREITUNG

Unabhängig vom Probenentnahmeröhrchen sollte der Liquor unmittelbar nach der Punktion im externen Zentrum zentrifugiert werden, um den Liquorüberstand von den Zellen zu trennen. Detaillierte Informationen finden Sie in den entsprechenden SOP-Dokumenten für hausinterne Liquorlabore.

➡️ Detailliertes Protokoll für hausinterne Liquorlabore:

[Download: SOP zur initialen Probenaufbereitung[S4] ]

KOSTENÜBERNAHME

Die Liquid Biopsy Diagnostik aus Liquor wird in Heidelberg als molekulargenetische Diagnostik abgerechnet. Die Abrechnung erfolgt nach GOÄ/EBM und kann auf Anfrage erläutert werden. Proben werden nur bearbeitet, wenn eine Kostenübernahme gewährleistet ist. Bitte beachten Sie: Auch wenn nach Bewertung im Neuro Liquid Biopsy Board keine Indikation zur Sequenzierung (siehe beim Punkt Indikationsstellungen) gestellt wird, fällt eine Grundgebühr für die durchgeführten Voruntersuchungen an.

Je nach Versicherungsstatus ist Folgendes zu beachten

Bei Probeneinsendung aus Deutschland beachten Sie bitte:

Gesetzlich versicherte Pat. (Deutschland):

Ausgefüllter Überweisungsschein für in-vitro-diagnostische Auftragsleistungen (Vordruck Nr. 10) mit Unterschrift und Stempel.

Privat versicherte Pat. (Deutschland):

Unterschriebene Kostenübernahmeerklärung.

➡️ Für privatversicherte Patient:innen (Deutschland):

[Download: Kostenübernahmeerklärung (Privatversicherte)[S5] ]

➡️ Optionaler Antrag an die PKV:

[Download: Antrag auf Kostenübernahme (Privatversicherte)][S6]

Bei Probeneinsendung aus dem Ausland beachten Sie bitte:

EU-Ausland:
Ausgefüllter S2-Schein mit Unterschrift und Stempel.
Nicht-EU-Ausland:

Bitte kontaktieren Sie das International Office des Universitätsklinikums Heidelberg: international.office@med.uni-heidelberg.de

Hinweis: Liegt keine schriftliche Kostenübernahme vor, wird die Probe nicht bearbeitet. Bei fallspezifischen Fragen zur Kostenübernahme wenden Sie sich bitte per E-Mail oder telefonisch an unser Team.

PROBENVERSAND

Bei Entnahme im cfDNA-Röhrchen: Versand von Liquor und Blut bei Raumtemperatur.
Bei Entnahme in Standard-Röhrchen: Versand von Liquor und Blut auf Trockeneis.

Versandadresse:

Liquid Biopsy Lab Hirntumore
z.H. Andrea Dormann / Sandy Walter
Im Neuenheimer Feld 400
69120 Heidelberg
Deutschland

➡️ Versanddetails inkl. Röhrchen/Temperatur/Unterlagen:

[Download: Einsender-SOP zur Probenentnahme und zum Versand[S7] ]

➡️ Vollständigkeit vor Versand prüfen:

[Download: Checkliste zur Einsendung[S8] ]

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*English*

SAMPLE SUBMISSION

For optimal sample quality, CSF should be collected directly into a Cell-free DNA tube (e.g., Streck cell-free DNA BCT® CE). These tubes can be provided by the Liquid Biopsy Lab Brain Tumors upon request. If this is not possible, the CSF must be centrifuged immediately after puncture to separate the supernatant from the cellular fraction. In addition, a germline reference sample is required. This is obtained from EDTA blood collected in a standard EDTA tube.

➡️ Practical step-by-step instructions:

[Download: Submitter SOP for sample collection and shipping[S9] ]

➡️Submission form (please complete and include):

[Download: Submission form[S10] ]
➡️ Pre-shipping checklist:

[Download: Submission checklist[S11] ]

INITIAL SAMPLE PREPARATION

Regardless of the collection tube used, the CSF should be centrifuged immediately after puncture at the referring center to separate the supernatant from the cellular fraction.

Detailed instructions can be found in the corresponding SOP documents for in-house CSF laboratories.

➡️ Detailed protocol for in-house CSF laboratories:

[Download: SOP for initial sample processing[S12] ]

COST COVERAGE

Liquid biopsy diagnostics from CSF are billed as molecular genetic diagnostics in Heidelberg. Billing is carried out according to GOÄ/EBM and can be explained upon request. Samples will only be processed if cost coverage is guaranteed.

Please note: Even if no indication for sequencing is made following review in the Neuro Liquid Biopsy Board (see “Indication decision” below), a basic fee for the preliminary analyses performed will be charged.

For sample submission from abroad:

Depending on the country of origin, please note the following:

EU countries:

Completed S2 form with signature and stamp.

Non-EU countries:

Please contact the International Office of Heidelberg University Hospital: international.office@med.uni-heidelberg.de

Note: If there is no written confirmation of cost coverage, the sample will not be processed. For case-specific questions regarding cost coverage, please contact our team by email or phone.

SAMPLE TRANSFER

If CSF is collected in cfDNA tubes: ship CSF and blood at room temperature.
If CSF is collected in standard tubes: ship CSF and blood on dry ice.

Shipping address:

Liquid Biopsy Lab Hirntumore
Attn: Andrea Dormann / Sandy Walter
Im Neuenheimer Feld 400
69120 Heidelberg
Germany

➡️ Shipping details including tube type / temperature / documents:

[Download: Submitter SOP for sample collection and shipping[S13] ]

➡️ Checklist prior to shipping:

[Download: Submission checklist[S14] ]

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ABLAUF NACH PROBENEINGANG / WORKFLOW AFTER SAMPLE SUBMISSION

*English version below*

PROBENEINGANGSBESTÄTIGUNG
Nach Eingang der Probe erhalten Sie eine Eingangsbestätigung per E-Mail.

PROBENQUALITÄTSBESTIMMUNG
Nach dem Probeneingang wird die cfDNA aus dem Liquor isoliert und hinsichtlich ihrer Qualität beurteilt. Diese kann unter anderem durch die Versandbedingungen (schnelle Trennung von Liquorüberstand und -zellen), Tumorlokalisation oder Tumorgehalt beeinflusst werden. Die Qualität der eingesandten Blutprobe ist in der Regel ausreichend und stellt üblicherweise keinen limitierenden Faktor dar.

➡️ Hinweise zur initialen Probenaufbereitung (für externe Liquorlabore):

[Download: SOP zur initialen Probenaufbereitung[S15] ]

INDIKATIONSSTELLUNG
Im interdisziplinären Neuro Liquid Biopsy Board wird anhand von Probenqualität und klinischer Fragestellung beurteilt, ob der Assay mittels NGS-Panel sinnvoll ist.

Liegt die Probenqualität außerhalb des validierten Bereichs, kann von einer Sequenzierung abgeraten werden.

Bitte beachten Sie: Auch wenn nach Bewertung im Neuro Liquid Biopsy Board keine Indikation zur Sequenzierung gestellt wird, fällt eine Grundgebühr für die durchgeführten Voruntersuchungen an.

➡️ Zur korrekten Angabe der klinischen Fragestellung / Board-Teilnahme:

[Download: Einsendeformular[S16] ]

BOARDVORSTELLUNG

Bei negativer Indikationsstellung werden Sie informiert. Eine Sequenzierung ist grundsätzlich noch möglich; hierbei muss das erhöhte Risiko eines unauffälligen Befunds berücksichtigt werden.

Bei positiver Indikation erfolgt die molekulargenetische Analyse mit anschließender Fallbesprechung im Board. Eine Einladung erfolgt per E-Mail.

➡️ E-Mail-Adresse für Einladung und Kontaktdaten:

[Download: Einsendeformular[S17] ]

BEFUNDÜBERMITTLUNG
Der finale Befund wird in der Regel innerhalb von zwei Arbeitstagen nach der Boardbesprechung postalisch oder per Fax übermittelt.

➡️ Fax / Postadresse für Befundzustellung:

[Download: Einsendeformular[S18] ]

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*English*

SAMPLE RECEIPT CONFIRMATION
Once the sample has arrived, you will receive a confirmation of receipt by email.

SAMPLE QUALITY ASSESSMENT
After arrival, cfDNA is isolated from the CSF sample and its quality is assessed. Sample quality may vary depending on shipping conditions (including rapid separation of CSF supernatant and cells), tumor location, or tumor fraction in CSF. The quality of the submitted blood sample is usually sufficient and typically not a limiting factor.

➡️ Guidance on initial sample processing (for external CSF laboratories):

[Download: SOP for initial sample processing[S19] ]

INDICATION DECISION
Within the interdisciplinary Neuro Liquid Biopsy Board, the indication for sequencing is assessed based on sample quality, the clinical question, and prior experience, to determine whether a liquid biopsy is appropriate and likely to be informative in the given case. If sample quality is outside the validated range of the assay, sequencing may be discouraged. In this case, you will be informed accordingly. Please note: Even if no indication for sequencing is made, a basic fee for the preliminary analyses performed will be charged.

➡️ To ensure accurate documentation of the clinical question and board participation:

[Download: Submission form[S20] ]

BOARD DISCUSSION
If the indication is negative, you will be informed. Sequencing may still be performed; however, the increased risk of an uninformative (non-contributory) result should be considered. If the indication is positive, molecular genetic analysis is performed and the case is discussed in the board. You will receive an invitation by email.

➡️ Email address for board invitation and contact details:

[Download: Submission form[S21] ]

REPORT DELIVERY
The final report is usually transmitted electronically or by fax to the referring center within two working days after the board discussion.

➡️ Fax / postal address for report delivery:

[Download: Submission form[S22] ]

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WICHTIGE FORMULARE ZUM DOWNLOAD

*English version below*

Formulare zur Probeneinsendung aus Deutschland

Formulare zur initialen Probenaufbereitung